EM: App para clA�nicos

Julio 2015.- Investigadores del IDIBAPS y del Hospital ClA�nic de Barcelona han creado la primera representaciA?n informA?tica que contiene conocimiento sobre la esclerosis mA?ltiple (EM) para avanzar en la investigaciA?n traslacional y clA�nica de la enfermedad. Esta herramienta permite recopilar informaciA?n A?til sobre los tratamientos o las enfermedades asociadas a la EM y que contienen tanto artA�culos cientA�ficos como historias clA�nicas.

La EM es una enfermedad crA?nica y de larga evoluciA?n desde que aparecen los primeros sA�ntomas y para entenderla bien es necesario integrar una gran cantidad de informaciA?n que proviene de diversas fuentes. En el estudio, coordinado por Pablo Villoslada, jefe del grupo IDIBAPS a�?PatogenA�tica y nuevas terapias en Esclerosis MA?ltiplea�?, han participado Xavier Pastor y Raimundo Lozano de la Unidad de InformA?tica MA�dica del Hospital ClA�nic y Albert SA?iz, del servicio de NeurologA�a del hospital.

Esta herramienta contiene, de forma explA�cita, conocimiento disponible sobre una enfermedad en concreto, las enfermedades secundarias y las relaciones que puedan existir entre ellas (comorbilidad), y que permite extraer informaciA?n. Se trata de un sistema muy potente ya que los conceptos estA?n perfectamente identificados y la informaciA?n contenida es independiente del idioma o de los sinA?nimos que se puedan emplear para designar un mismo concepto.

En el artA�culo que publica a�?Plos Onea�?, los investigadores utilizaron herramientas para el anA?lisis de texto y escanearon, en paralelo, los datos de las historias clA�nicas anonimizadas de mA?s de 600 pacientes con EM del ClA�nic y los artA�culos cientA�ficos relacionados con esta enfermedad que aparecen en PubMed, el portal de bA?squeda de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE UU. De aquA� se extrajeron las entidades conceptuales relacionadas con la enfermedad y otros datos para elaborar la ontologA�a.

Para validar esta herramienta, los investigadores cruzaron los resultados de las dos aproximaciones (historias clA�nicas de pacientes y artA�culos sobre EM referenciados en Pubmed) para encontrar las comorbilidades y comprobaron que las enfermedades coexistentes encontradas eran las mismas. TambiA�n les permitiA? descubrir relaciones que no estaban descritas en los textos.

Esta ontologA�a mA�dica, la primera que existe para EM, ya se ha puesto a disposiciA?n de la comunidad cientA�fica, ya que estA? en el repositorio de ontologA�as a�?Bioportal del Centro Nacional Americano para OntologA�as BiomA�dicasa�?, y permitirA? avanzar en la investigaciA?n clA�nica y traslacional de esta enfermedad.